يظهر خيار إدارة الملفات في الصفحة الرئيسية للسي بانل، حيث تتم تتم إدارة ملفات الموقع الإلكتروني من خلال هذا الخيار كما يظهر في الصورة التالية:

يتيح مدير الملفات في السي بانل الخيارات الآتية:

1. تصفح وملاحة ملفات الموقع الإلكتروني.
2. إنشاء ملف جديد.
3. إنشاء مجلد جديد.
4. حذف الملفات غير المرغوب بها.
5. عرض وتحرير الملفات.
6. إعادة تسمية الملفات والمجلدات.
7. نقل الملفات والمجلدات.
8.نسخ الملفات والمجلدات.
9. تغيير أذونات الملفات والمجلدات.
10. رفع الملفات إلى الاستضافة.
11. تنزيل الملفات من الاستضافة إلى جهاز الحاسوب.
12. فك ضغط ملف مضغوط واستخراج محتوياته.
13. ضغط الملفات في ملف مضغوط.
14. البحث في ملفات الموقع.
15. إظهار الملفات المخفية.